mam zintegrowaną kartę dźwiękową Realtek ALC260 (HD Audio) na płycie głównej FUJITSU-SIEMENS D2156+. Na arch linuxie miałem podobny problem, mianowicie dźwięk leciał tylko z głośnika systemowego, każdy dźwięk. Pomogło nie ładowanie modułów pcspkr i snd_pcsp.
Na ubuntu te moduły są już dodane do blacklist... a dźwięk mimo to leci z głośników (wyjście audio) i z głośnika systemowego (obudowa pc).
posiadam najnowsze, aktualizowane codziennie(?) ubuntu.
głośniczek systemowy mogę przyciszyć do minimum (nie mylić z mute) suwakiem z alsamixer (kanał headphones, dziwne, że nie master), zmutowanie go owocuje wyłączeniem dźwięku w głośniczku jak i w głośnikach.