Twoje pytanie zawiera w sobie odpowiedź, bo skoro chcesz robić backup systemu, to musisz uwzględnić wszystko (każdy folder i plik). Tworzenie kopii bezpieczeństwa jest wysoce wskazane. Pomyśl - jaki to komfort psychiczny mieć zabezpieczoną (najlepiej na zewnętrznym nośniku) kopię zapasową dobrze działającego systemu. Można wtedy beztrosko "grzebać" w systemie, a jeśli coś się schrzani, to w ciągu kilku minut przywracasz sobie działający system. Zasada jest taka: programy do backupu powinny być używane na systemie niedziałającym, na partycjach oczyszczonych ze śmieci i odmontowanych. Dlaczego należy oczyścić partycje? Otóż dlatego: usunięcie niepotrzebnych danych to krótszy czas tworzenia kopii, mniejszy jej rozmiar, krótszy czas kopiowania/przenoszenia jej w bezpieczne miejsce, krótszy czas odtwarzania. Istnieją specjalne tzw. narzędziowe dystrybucje Linuksa, które poza programami archiwizacyjnymi mają szereg innych ciekawych i pożytecznych programów. Dobra jest np. dystrybucja Parted Magic (niestety płatna) oraz GParted. Ja do tworzenia kopii zapasowej używam innej dystrybucji zainstalowanej na dysku laptopa. Obecnie mam zainstalowane: Windows na /dev/sda2, Arch na /dev/sda6, Ubuntu na /dev/sda7 i Manjaro na /dev/sda8. Mam jeszcze dwie partycje wolne, na których instaluję w celach poznawczych inne distra. Kopie zapasowe przechowuję na partycji /dev/sda3, która w każdej zainstalowanej dystrybucji jest montowana do katalogu /mnt/03. Na tej partycji mam też wiele pakietów, których nie oferuje repozytorium, trzymam też pomocne pliki z ustawieniami, notatkami na temat rozwiązywania problemów. Do archiwizacji używam maleńkiego programiku fsarchiver, który jest dostępny w repo każdej dystrybucji. Jest to program konsolowy, ale istnieje też dla niego graficzna nakładka - tej nie używam. Jeżeli chcę wykonać kopię bezpieczeństwa systemu Ubuntu to:
loguję się np. w Arch Linux
odmontowuję partycję /dev/sda7 (na niej mam Ubuntu)
wydaję polecenie: sudo fsarchiver savefs -v /mnt/03/Zapas/Partkopie/nazwa_archiwum.fsa /dev/sda7
To polecenie spowoduje, że program fsarchiver utworzy we wskazanym mu katalogu kopię systemu Ubuntu o wskazanej nazwie, które to Ubuntu znajduje się na partycji /dev/sda7. Tworzenie kopii trwa kilkanaście minut. Program kompresuje dane tak, że z 4,62 GB powstaje kopia o rozmiarze 1,8 GB. Program fsarchiver ma wiele opcji. O jego obsłudze możesz poczytać tutaj:
http://osworld.pl/fsarchiver-czyli-backup-z-konsoli/ Artykuł jest stary, ale informacje nadal aktualne. Odtworzenie danych z kopii, które trwa wyraźnie krócej, wykonuję tak:
sudo umount /dev/sda7
sudo fsarchiver restfs -v /mnt/03/Zapas/Partkopie/nazwa_archiwum.fsa id=0,dest=/dev/sda7
Jeżeli chcę wykonać kopię Arch-a, to loguję się do Ubuntu albo Manjaro. Nie muszę więc stosować dystrybucji z nośników innych. Ułatwieniem jest to, że żadna z wymienionych dystrybucji nie ma katalogu /home na odrębnej partycji. Takie dane jak filmy, muzyka, foty, dokumenty trzymam na partycji /dev/sda5 z systemem plikowym NTFS. Dzięki temu mam do nich dostęp również spod Windows. W katalogach /home linuksowych dystrybucji mam tylko linki do katalogów z tymi filmami, muzyką itp.