Wytnij foldery o nazwach gtk-2.0 i gtk-3.0 z folderu ~/.config i przenieś w inne miejsce, abyś mógł je ewentualnie przywrócić. Zamiast nich
skopiuj tam takie foldery z twojego motywu graficznego. Nie wiem czy to pomoże, nie mam Unity, które może nie mieć/nie potrzebować tych folderów.
Odśwież motyw poprzez wybranie innego i powrót lub się przeloguj.
W ostateczności możesz edytować motyw i samemu ustawić kolory tła
viewtopic.php?f=145&t=176153#p997831